Total Commander Ultima Prime – joukko erilaisia ​​ohjelmia ja lisäasetuksia Total Commander-tiedostonhallinnan toimivuuden laajentamiseksi. Ohjelmisto auttaa järjestämään tiedostoja ja kansioita, tekemään tarvittavat tiedot, siirtämään ne ja tekemään monia muita tiedostojen hallintaan liittyviä tehtäviä. Total Commander Ultima Prime sisältää KeePassin hallita salasanoja, TeamViewer etäkäyttöön, Gimp ja XnView kuvien käsittelemiseen, AIMP toistaa äänen jne. Ohjelmisto tukee komentojonojen käsittelyä, toimii eri arkistotiedostojen ja palojen kanssa CD-levyjä. Total Commander Ultima Prime mahdollistaa myös värimallin, valikkojen, fonttien, ikkunanäkymän ja käyttöliittymän muiden osien mukauttamisen yksilöllisiin tarpeisiin.