Comodo Uninstaller – pieni apuohjelma Comodo-virusten poistamiseksi. Ohjelmisto on hyödyllinen tapauksissa, joissa perinteiset Windows-menetelmät eivät pysty täysin poistamaan Comodo Antivirus-, Comodo Internet Security-tai Comodo-palomuuria. Comodo Uninstaller auttaa poistamaan kaikki tietoturvatuotteiden jäämät järjestelmästä, mukaan lukien rekisterimerkinnät, tiedostot, ohjaimet ja käynnistystiedot. Ohjelmisto aloittaa skannausprosessin virustorjuntaan liittyvien tiedostojen havaitsemiseksi ja poistaa kaikki havaitut tähteet. Järjestelmän puhdistamisen jälkeen Comodo Uninstaller edellyttää tietokoneen käynnistämistä uudelleen poistamisen suorittamiseksi.